应用生物信息学软件分析了PRV和TGEV全基因序列的密码子偏爱性,分别计算了其RSCU,Nc,GC,GC3S,双核苷酸组成,根据计算的结果运用GC3s-Nc分布图,GC12-GC3s散点图,对应分析解析了TGEV和PRV密码子用法发生偏爱的主要影响因素,结果表明,PRV主要偏爱于使用以G和C结尾的密码子,而TGEV则主要使用以A和U结尾的密码子,影响PRV密码子偏爱G,C的主要因素是碱基组成限制,碱基突变,翻译选择和基因功能,TGEV的影响因素则只有碱基组成限制,碱基突变,翻译选择对其密码子的用法无影响.
关键词: 传染性胃肠炎病毒; cDNA克隆; 重组病毒;表达; 密码子偏爱性
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作者姓名:殷华平
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